{r3dmol} v0.1.2 is now available on CRAN. By using {r3dmol}, you could create rich and fully interactive 3D visualizations of molecular data, and embed pdbs easily into a rmarkdown report or blogdown post.

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现在的中文网络上其实并不缺乏教新手如何去创建和开发一个 R 包,只要很随意的搜索一下,就能找到不少可以参考的资料。那么问题来了,为什么我还要再写一篇来分享如何创建 R 包的文章呢?动机其实也很简单,由于 R 社区的不断发展,{usethis}{testthat}{styler}{lintr}{pkgdown} 等等各类便于开发的工具层出不穷,在这些工具的帮助下,开发一个包的学习曲线愈发地降低。而现在中文网络中基于这些更为现代化工具的开发新手级入门教程还是尚且偏少。

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本文主要介绍一下自己利用业余时间开发的分子结构3D可视化R包 {r3dmol}{r3dmol} 基于一个老牌的 JavaScript 的3D分子结构可视化库 3Dmol.js{htmlwidgets} 开发而成。利用 3Dmol.js{htmlwidgets} 开发了 {r3dmol} 这个 R 包,以方便日常用 R 进行分析的科研人员实现在分析文档中对分子、蛋白质结构进行可视化,免去了打开 PyMOL 等软件对结构进行绘制后在通过导出图片复制粘贴到文档中的繁琐操作。

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Su Wei

Opportunity favors only the prepared mind.

Front-end Engineer

Tokyo, Japan